Нанотехнологическое сообщество Нанометр, все о нанотехнологиях
на первую страницу Новости Публикации Библиотека Галерея Сообщество Объявления Олимпиада ABC О проекте
 
  регистрация
помощь
 

Бесплатный онлайн-курс "Основы Linux" от Института биоинформатики

Ключевые слова:  Linux, биоинформатика, геном

22 августа 2015

Введение в Linux

ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТЬ
3 модуля

НАГРУЗКА

3-4 часа в неделю

О КУРСЕ

Курс знакомит слушателей с операционной системой Linux и основами её использования. В рамках курса мы покажем как установить Linux на ваш компьютер, расскажем о программах в нем, поработаем в терминале, зайдем на удаленный сервер и рассмотрим еще несколько продвинутых тем. Стоит отметить, что курс не является исчерпывающим и рассказывает только о базовых возможностях Linux, но, несмотря на это, рассказанного материала достаточно для успешного выполнения разноплановых задач в системе Linux.

ИНТРО СЕРТИФИКАТ Институт биоинформатики ФОРМАТ КУРСА Видео-лекции, тесты, задачи на написание скриптов и выполнение команд на сервере ЯЗЫК Русский ЦЕЛЕВАЯ АУДИТОРИЯ Пользователи с опытом работы в Windows или Mac OS X и желанием освоить Linux. СОЗДАТЕЛЬ Bioinformatics Institute ПОДЕЛИТЬСЯ ПРЕПОДАВАТЕЛИ

Алексей Гуревич

Институт биоинформатики, СПбАУ РАН

С отличием закончил бакалавриат СПбГПУ и магистратуру СПбАУ по направлению «разработка программного обеспечения». В настоящее время является аспирантом СПбАУ. С биоинформатикой впервые познакомился в 2011 году, когда проходил стажировку в Лаборатории алгоритмической биологии при Академическом университете. После успешного завершения стажировки продолжает работу в лаборатории. Состоит в команде разработчиков геномного ассемблера SPAdes и является соавтором трех статей об ассемблере и его модулях (2012, 2013, 2014). Алексей – главный разработчик инструмента по оценке качества геномных сборок QUAST и автор статьи о нем (2013). В круг научных интересов Алексея входит биоинформатика (сборка геномов, анализ онкологических данных), разработка алгоритмов, разработка удобного ПО для биологов и биоинформатиков. Преподавал курс «Разработка научного программного обеспечения» и семинары по алгоритмической биоинформатике магистрантам СПбАУ (оба в 2014). Провел интенсивный мини-курс «Программирование на языке Python для биологов» на первой Летней школе по биоинформатике (Москва, 2013). Ведет программирование в лицее «ФТШ» при СПбАУ (с 2012).

Андрей Пржибельский

Институт биоинформатики, СПбАУ РАН

Андрей закончил в 2010 году бакалавриат СПбГПУ, после чего учился в магистратуре СПбАУ по направлению «разработка программного обеспечения». Параллельно окончил Академию современного программирования (ныне Computer Science Center). В настоящее время является асприантом СПбАУ. С 2011 года работает в Лаборатории алгоритмической биологии. Андрей занимается разработкой геномного ассемблера SPAdes, который на данный момент признан бактериальным сборщиком №1. Во время работы в лаборатории также выступил соавтором ряда публикаций, прочитал ряд лекций и докладов на различных международных конференциях и школах. В 2014 году получил приз за лучшую студенческую работу на крупнейшей конференции в области вычислительной биологии ISMB 2014. С 2012 регулярно читает лекции по анализу данных NGS и алгоритмам в биоинформатике в СПбАУ и Институте биоинформатики. Из профессиональных интересов основными являются вычислительная геномика, транскриптомика и разработка алгоритмов.

ТРЕБОВАНИЯ

Курс рассчитан на начинающих пользователей Linux и не требует никаких предварительных знаний об этой операционной системе и даже её наличия на своем компьютере. Для более продвинутых пользователей интерес могут представлять отдельные занятия курса (например, про работу с удаленным сервером или про программирование на языке bash). Для прохождения курса также будет полезно (но необязательно) знание английского языка на уровне чтения технических текстов.

ОПИСАНИЕ

В рамках представленного курса слушатели познакомятся с операционной системой Linux и её базовыми возможностями. Наличие установленного Linux на компьютере не требуется, так как мы начнём знакомство с этой операционной системой с самого начала, а именно с ее установки.

Далее в курсе будут рассмотрены основные возможности графического интерфейса Linux, которые очень напоминают знакомые большинству слушателей Windows или Mac OS X. После этого мы перейдем к изучению работы через командную строку, которая поначалу может показать не очень удобной, но постепенно станут понятны ее преимущества над графическим подходом.

Следующий блок курса посвящен работе на удаленном сервере. Мы научимся заходить на него, запускать различные программы удаленно, а также копировать результаты их выполнения на свой локальный компьютер для дальнейшего анализа.

Заключительная часть курса рассматривает несколько продвинутых тем, включающих в себя основы написания скриптов на языке bash, использование многофункционального текстового редактора vim и другие.

В течение курса всем слушателям будет предложен ряд тестов и практических заданий на понимание и использование системы Linux. Кроме того, будет и несколько заданий по написанию небольших программ на языке bash.

Источник: https://stepic.org/course/%D0%92%D0%B2%D0%B5%D0%B4%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5-%D0%B2-Linux-73/

Алмаз в горной породе
Алмаз в горной породе

Премии Правительства Москвы молодым ученым за 2019 год
Объявлены лауреаты премии Правительства Москвы молодым ученым за 2019 год. Премией отмечены 50 работ молодых столичных ученых. Среди лауреатов 12 сотрудников МГУ имени М.В.Ломоносова. Конкурс на получение премий Правительства Москвы молодым ученым проводится с 2013 года. Торжественное награждение победителей состоится 7 февраля 2020 года в Государственном Кремлевском дворце.

Перст-дайджест
В новом выпуске бюллетеня «ПерсТ»: Перерождение кремния: от полупроводника к металлу. Морская губка – основа для создания новых наноструктурных композитов. Нитрид-борные аналоги углеродных колец. Лучшие научные сюжеты года по версии APS. Сверхпроводимость ставит новый температурный рекорд. Звук переносит массу? Всяко-разно.

Наносистемы: физика, химия, математика (2019, том 10, № 6)
Опубликован новый номер журнала "Наносистемы: физика, химия, математика". Ознакомиться с его содержанием, а также скачать необходимые Вам статьи можно по адресу: http://nanojournal.ifmo.ru/articles/volume10/10-6
Там же можно скачать номер журнала целиком.

Да пребудет с вами сила плазмонов!
А.А.Семенова, Э.Н.Никельшпарг, Е.А.Гудилин, Н.А.Браже
Ученые Московского университета приблизились к решению проблем современной медицинской диагностики с использованием единичных клеток и их органелл путем разработки новых неинвазивных оптических методов анализа.

Юрий Добровольский: «Через 50 лет вся энергия будет вырабатываться биоорганизмами»
Андрей Бабицкий, Юрий Добровольский
Главный редактор ПостНауки Андрей Бабицкий побеседовал с химиком Юрием Добровольским о науке о материалах, будущем энергетики и новых аккумуляторах

Константин Жижин, член-корреспондент РАН: «Бор безграничен»
Наталия Лескова
Беседа с К.Ю. Жижиным, заместителем директора Института общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова по научной работе, главным научным сотрудником лаборатории химии легких элементов и кластеров.

Технонано

Технопредпринимательство - идея, которая принесет свои плоды при бережном культивировании и взращивании. И наша наноолимпиада, и Наноград от Школьной Лиги РОСНАНО, и проект Стемфорд, и другие замечательные инициативы - важные шаги на пути реализации этой и других идей, связанных с развитием новых высоких технологий в нашей стране и привлечением молодых талантов в эту вполне стратегическую область. Ниже приведен небольшой опрос, который позволит и нам, и вам понять, а что все же значит этот модный термин, и какова его суть.

Технопредпринимательство на марше

Мы традиционно просим вас высказать свои краткие суждения по вопросу технопредпринимательства и проектной деятельности школьников. Для нас очевидно, что под технопредпринимательством и под проектной деятельностью школьников каждый понимает свое, но нам интересно ваше мнение, заодно вы сможете увидеть по мере прохождения опроса, насколько оно совпадает или отличается от мнения остальных. Ждем ваших ответов!

О наноолимпиаде замолвите слово...

Прошла XII Всероссийская олимпиада "Нанотехнологии - прорыв в Будущее!" Мы надеемся, что нам для улучшения организации последующих наноолимпиад поможет электронное анкетирование. Мы ждем Ваших замечаний, пожеланий, предложений. Спасибо заранее!



 
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.