Нанотехнологическое сообщество Нанометр, все о нанотехнологиях
на первую страницу Новости Публикации Библиотека Галерея Сообщество Объявления Олимпиада ABC О проекте
 
  регистрация
помощь
 

Лекции профессора Хенрика Флювберга

Ключевые слова:  МГУ им. Ломоносова, Хенрик Флювберг, Химфак

Опубликовал(а):  Доронин Федор Александрович

29 сентября 2013

2 и 3 октября в 446 аудитории химического факультета МГУ состоятся лекции профессора факультета микро- и нанотехнологий Технического Университета Дании (Копенгаген) Хенрика Флювберга «Integrated view of genome structure and sequence of a single DNA molecule in a nanofluidic device» и «Optimized localization-analysis for single-molecule tracking and super-resolution microscopy».

Начало первой лекции 2 октября – 12 часов. Приглашаются студенты, аспиранты, научные сотрудники, все желающие. Лекции – на английском языке. Если у вас нет пропуска в МГУ, обращайтесь к Гудилину Евгению Алексеевичу.

Integrated view of genome structure and sequence of a single DNA molecule in a nanofluidic device

Is it possible to see the genetic contents of a single DNA molecule in a light microscope? Obviously not: A light microscope can only distinguish points more than 100 nm apart while base-pairs in DNA pack three to one nanometer. On the other hand: DNA is inhomogeneous on many length scales, so the real question is: How much can one see, if one can observe DNA with 1 kb resolution? In order to get that resolution, one must stretch a DNA molecule fully, turn off its Brownian motion, and make its large-scale structure light up. We did that with an intercalating fluorescent dye and simple physical methods. In long (~2 Mb) DNA molecules extracted from whole chromosomes in a nanofluidic lab-ona- chip, we detected repetitive elements, known structural variation, as well as unique structural variations. After being mapping in this manner, a molecule of interest was rescued from the chip, amplified, and analyzed with standard methods of genetics, including sequencing to 1-bp resolution. This confirmed what we had observed with light microscopy. I will explain how theoretical physics contributed critically to the success of this project.

Optimized localization-analysis for single-molecule tracking and super-resolution microscopy

In single-molecule tracking and localization microscopy, spatial resolution of a few nanometers is achieved. This is a hundred times below the diffraction limit. Also, far-field super-resolution techniques now exist, such as photo-activated localization microscopy (PALM) and stochastic optical reconstruction microscopy (STORM), which sequentially isolate each fluorescent probe in a densely labeled sample to resolve intracellular protein localization patterns to within a few nanometers. Additional development and application of super-resolution microscopy is likely to provide insight into cellular processes at both systems and mechanistic levels. With such popularity of a technique, it is natural to ask whether it is optimal. That is: How does one optimally localized isolated fluorescent beads and molecules imaged as diffraction-limited spots? How does one optimally determine the orientation of fluorescent molecules? How does one obtain reliable formulas for the precision of various localization methods? Answer: Usemaximum-likelihood estimation and physically correct point-spread functions. Doing that, both theory and experimental data show that
(A) the very popular non-weighted least-squares fit of a Gaussian point-spread function to data squanders one-third of the available information,
(B) a popular formula for its precision exaggerates beyond the information limit, and
(C) a weighted least-squares fit may look like an improvement, but may do worse, whereas
(D) maximum-likelihood fitting is practically optimal.
I will explain everything in terms of basic physics and a little statistics.





Для того чтобы оставить комментарий или оценить данную публикацию Вам необходимо войти на сайт под своим логином и паролем. Зарегистрироваться можно здесь

 

Тетраподы ZnO
Тетраподы ZnO

Интервью с участниками, авторами задач и организаторами XIII Олимпиады
Предлагаем ознакомиться с подборкой видеороликов - миниинтервью, взятых в течение очного тура XIII Всероссийской Интернет-олимпиады по нанотехнологиям "Нанотехнологии - прорыв в будущее!" (25 - 30 марта 2019 года).

Неделя Олега Лосева
Портал RSCI.RU и инициаторы проведения "Недель Олега Лосева" приглашают все вузы и факультеты физико-технологического и радиоэлектронного профиля к участию в первой Неделе Олега Лосева в Рунете, посвященной Олегу Владимировичу Лосеву - признанному пионеру полупроводниковой электроники и оптоэлектроники.

Магистратура Московского университета по химической технологии
Химический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова объявляет о приеме в магистратуру "Химическая технология" для подготовки специалистов в области полимерных композиционных материалов, углеродных материалов, защитных покрытий.

Интервью с Константином Козловым - абсолютным победителем XIII Наноолимпиады
Семенова Анна Александровна
Школьник 11 класса Константин Козлов (г. Москва) стал абсолютным победителем Олимпиады "Нанотехнологии - прорыв в будущее!" 2018/2019 по комплексу предметов "физика, химия, математика, биология". О своих впечатлениях, увлечениях и немного о планах на будущее Константин поделился с нами в интервью.

Микроэлементарно, Ватсон: как микроэлементы действуют на организм
Алексей Тиньков
Как на нас воздействуют кадмий, ртуть, цинк, медь и другие элементы таблицы Менделеева рассказал сотрудник кафедры медицинской элементологии РУДН Алексей Тиньков в интервью Indicator.Ru

Зимняя научная конференция студентов 4 курса ФНМ МГУ 22-23 января 2019 г.
Сафронова Т.В.
Настоящий сборник содержит тезисы докладов зимней научной студенческой конференции студентов 4-го курса ФНМ

Технопредпринимательство на марше

Мы традиционно просим вас высказать свои краткие суждения по вопросу технопредпринимательства и проектной деятельности школьников. Для нас очевидно, что под технопредпринимательством и под проектной деятельностью школьников каждый понимает свое, но нам интересно ваше мнение, заодно вы сможете увидеть по мере прохождения опроса, насколько оно совпадает или отличается от мнения остальных. Ждем ваших ответов!

О наноолимпиаде замолвите слово...

Прошла XII Всероссийская олимпиада "Нанотехнологии - прорыв в Будущее!" Мы надеемся, что нам для улучшения организации последующих наноолимпиад поможет электронное анкетирование. Мы ждем Ваших замечаний, пожеланий, предложений. Спасибо заранее!

Опыт обучения в области нанотехнологического технопредпринимательства

В этом опросе мы просим поделиться опытом и Вашим отношением к нанотехнологическому технопредпринимательству и смежным областям. Заранее спасибо за Ваше неравнодушие!



 
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.