В 2008 году в рамках реализации приоритетного национального проекта «Образование» школа выиграла грант 1 млн. руб. в номинации «Образовательные учреждения, внедряющие инновационные образовательные программы».
В том же году ТГТУ и МОУ СОШ № 45 победили во Всероссийском конкурсе грантов на поставку и ввод в эксплуатацию учебных лабораторий по нанотехнологии для кабинетов физики, химии и биологии базовых общеобразовательных учреждений профильных вузов. В 2009 году школа внесена в национальный реестр «Ведущие образовательные учреждения России». МОУ СОШ № 45 – ресурсный методический центр, С 2008 года на базе школы работает инновационный центр передовых педагогических технологий, в котором учителя города повышают квалификацию по программам
«Современные проблемы преподавания химии в школе» и «Использование ИКТ в образовательном процессе».