Нанотехнологическое сообщество Нанометр, все о нанотехнологиях
на первую страницу Новости Публикации Библиотека Галерея Сообщество Объявления Олимпиада ABC О проекте
 
  регистрация
помощь
 
Схема эксперимента (a) и карта жесткости (b). После гибридизации поверхность сканируется с помощью АСМ для получения карты жесткости. Размер скана 3 мкм. Связанные молекулы менее жесткие (темно-коричневые кружки. dsDNA - ДНК с двойной спиралью, ssDNA - ДНК с одинарной спиралью. c) Рассчитанная жесткость в каждой точке. d) Эффективная жесткость. e) Компьютерное изображение, позволяющее посчитать число связанных молекул. f) Число связанных молекл на сканируемой площади 10 мкм как функция концентрации и на двух тестовых областях (квадраты 50 мкм и треугольники 5 мм).
Карта жесткости 25х25 мкм2 с разрешением 6 нм, демонстрирующая индивидуальные связанные молекулы. Время сканирования 2 часа. Концентрация ДНК 32пМ, а площадь связывания - 5х5 мм2. Число связанных молекул ~41,250.

Определяем ДНК - без проблем

Ключевые слова:  ДНК, онкология, РНК

Опубликовал(а):  Уточникова Валентина Владимировна

23 декабря 2009

Для обнаружения и определения молекул ДНК и РНК в биологических объектах существует множество методов, например, связывание целевой молекулы с моноспиральной пробой ДНК на разных поверхностях с последующим измерением флуоресценции или изменения поверхностного натяжения. Казалось бы, зачем нужны новые методы? Дело в том, что многие из существующих методик требуют получение целевых молекул в наномолярной концентрации, а "усилительные схемы" позволяют использовать фемтомолярные концентрации. Но ученые из Гарварда и Стэнфорда могут определять даже аттомолярные количества микроРНК в образцах опухолей. Для этого они измеряют жесткость молекул-проб до и после связывания с целевыми микроРНК.

Озгур Сахин с коллегами зафиксировали односпиральную ДНК на золотой подложке и позволили целевой ДНК связаться с ней, предварительно с помощью АСМ измерив ее жесткость. Результирующие карты жесткости показывают, что несвязанные молекула ДНК жестче, чем связанные с целевыми молекулами, а компьютерный анализ этих карт позволяет рассчитать число связанных молекул. С помощью этого метода можно определить концентрации вплоть до 1 аттомоля - это на восемь порядков лучше, чем все, что было до них! Кроме того, для проведения анализа образцов, полученных из опухолевых тканей мочевого пузыря и толстой кишки нужно всего 200 пг РНК - по сравнению с 1 мг в обычных экспериментах.

Такой наномеханический подход к определению ДНК и РНК хорош тем, что требует малых количеств генетического материала без дальнейшей обработки. Кроме того, он обладает гораздо большей производительностью.


Источник: Nature



Комментарии
Моноспиральная проба - ух

----
"усилительные схемы" позволяют использовать фемтомолярные концентрации.
----

Лукавят. В идеале можно ловить единичные молекулы. Обычно надёжная детекция - от сотен молекул ДНК.

----
нужно всего 200 пг РНК - по сравнению с 1 мг в обычных экспериментах.
----

1 мг - это просто невероятно до фига. Что-то не то.
Кстати, цвухцепочечная ДНК должна быть жёстче, а не наоборот...
Моноспиральная ДНК - это сильно сказано, да! Прям так по-русски! Односпиральная ДНК ничуть не лучше. Предположу, что имеется в виду одноцепочечная ДНК - ну так и незачем изобретать новые термины.

Александр Ринатович, может, один микрограмм? Для "обычных экспериментов" в большинстве случаев бывает достаточно одного микрограмма суммарной клеточной РНК. Хотя, если подумать, обычно все эксперименты такие необычные...

И кстати, по-моему тоже двуцепочечная ДНК должна быть жёстче, а не наоборот.
Белик Людмила Ивановна, 06 января 2010 19:13 
Знай люди , что они не биотела , как утвердила их считать горе-наука , а космическое существо в биотеле с собственным подсознанием и со сверхспособностями скрытыми (они для нас -космитов уже в космосе) почти каждый человек смог бы сам проверять свои системы на наличие онкологии и даже на начало в скоре . Нужно только ЗНАТЬ свой космизм и своё подсознание , и как связаться с ним точно . Есть 7 способов :
1 - определять магнетизм места с просто "кручением" или с монополем "север" .
2 - Проверить все системы головного мозга на онковсплески .
3 - Определить сияние везде и особенно в чашах-чакрах .
4 - Знать свойства ферромагнетизма гудеть , естественно , что слишком уж тихо .
5 и т.д. сложны для начинающих .

Людмила Белик

Для того чтобы оставить комментарий или оценить данную публикацию Вам необходимо войти на сайт под своим логином и паролем. Зарегистрироваться можно здесь

 

Природа любит порядок
Природа любит порядок

Приглашение на вебинар «Комбинация АСМ и оптических методик: новые достижения и приложения»
НТ-МДТ Спектрум Инструментс приглашает Вас принять участие в бесплатном вебинаре «Комбинация АСМ и оптических методик: новые достижения и приложения»

Наносистемы: физика, химия, математика (2019, том 10, № 1)
Опубликован новый номер журнала "Наносистемы: физика, химия, математика". Ознакомиться с его содержанием, а также скачать необходимые Вам статьи можно по адресу: http://nanojournal.ifmo.ru/articles/volume10/10-1
Там же можно скачать номер журнала целиком.

XXI Менделеевский съезд по общей и прикладной химии,
Уважаемые коллеги! Приглашаем вас принять участие в работе XXI Менделеевского съезда по общей и прикладной химии, который состоится с 9 по 13 сентября 2019 года в Санкт-Петербурге и станет одним из основных мероприятий Международного года Периодической таблицы химических элементов, провозглашённого ООН в декабре 2017 г.
Проводится под эгидой Международного союза по теоретической и прикладной химии (IUPAC).

Микроэлементарно, Ватсон: как микроэлементы действуют на организм
Алексей Тиньков
Как на нас воздействуют кадмий, ртуть, цинк, медь и другие элементы таблицы Менделеева рассказал сотрудник кафедры медицинской элементологии РУДН Алексей Тиньков в интервью Indicator.Ru

Зимняя научная конференция студентов 4 курса ФНМ МГУ 22-23 января 2019 г.
Сафронова Т.В.
Настоящий сборник содержит тезисы докладов зимней научной студенческой конференции студентов 4-го курса ФНМ

Самые необычные таблицы Менделеева на выставке Международного года Периодической таблицы химических элементов

6-8 февраля в Российской академии наук состоялось торжественное открытие Международного года периодической таблицы химических элементов в России и приуроченная к этому масштабная интерактивная выставка

Технопредпринимательство на марше

Мы традиционно просим вас высказать свои краткие суждения по вопросу технопредпринимательства и проектной деятельности школьников. Для нас очевидно, что под технопредпринимательством и под проектной деятельностью школьников каждый понимает свое, но нам интересно ваше мнение, заодно вы сможете увидеть по мере прохождения опроса, насколько оно совпадает или отличается от мнения остальных. Ждем ваших ответов!

О наноолимпиаде замолвите слово...

Прошла XII Всероссийская олимпиада "Нанотехнологии - прорыв в Будущее!" Мы надеемся, что нам для улучшения организации последующих наноолимпиад поможет электронное анкетирование. Мы ждем Ваших замечаний, пожеланий, предложений. Спасибо заранее!

Опыт обучения в области нанотехнологического технопредпринимательства

В этом опросе мы просим поделиться опытом и Вашим отношением к нанотехнологическому технопредпринимательству и смежным областям. Заранее спасибо за Ваше неравнодушие!



 
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.