Нанотехнологическое сообщество Нанометр, все о нанотехнологиях
на первую страницу Новости Публикации Библиотека Галерея Сообщество Объявления Олимпиада ABC О проекте
 
  регистрация
помощь
 

Научные группы: Лаборатория бионанотехнологии

Пышный Дмитрий Владимирович
Организация
Ключевые слова
Область деятельности
  • Медицина
  • Нанотехнологии
  • Химическая биология
Научные интересы
  • Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными
  • разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов
  • разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот
  • термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот
Контактная информация
Телефон +7 383 335-62-28
Факс +7 383 333-36-77
Электронная почта niboch@niboch.nsc.ru
Индекс 630090
Адрес Новосибирск,пр. ак. Лаврентьева, 8
Страница научной группы в интернете
Научный коллектив
    Пышный Дмитрий Владимирович, заведующий лабораторией, кандидат наук
Описание

Зав. лабораторией Пышный Дмитрий Владимирович, кандидат химических наук, доцент, зам. директора по научной работе Новосибирскиого института биоорганической химии СО РАН. Лауреат VII конкурса молодых ученых Европейской Академии наук (1999 г), лауреат премий журнала «Биоорганическая химия» (1997 и 1998 гг), лауреат премии издательства МАИК «Наука» (1998 г)


Основные научные результаты

  • Систематически изучены физико-химические особенности образования тандемных олигонуклеотидных комплексов с ДНК.
  • исследованы особенности ферментативного лигирования олигонуклеотидов на ДНК матрице в зависимости от нуклеотидной композиции в точке одноцепочечного разрыва ДНК
  • на основе метода лигирования коротких олигонуклеотидов (трехкомпонентных тандемов) разработан ряд тест-систем для диагностики известных полиморфных сайтов в анализируемой ДНК (Y-хромосома человека, фенилкетонурия (R408W), ген Pol ВИЧ-1, генотипирование ВГС)
  • систематически изучены физико-химические особенности образования ДНК-ДНК комплексов олигонуклеотидов, несущих ненуклеотидные вставки на основе олигометилендиолов и олигоэтиленгликолей (мостиковых олигонуклеотидов)
  • с использованием олигонуклеотидов зондов, несущих ненуклеотидные вставки, разработан высокоселективный подход к анализу точечных мутаций в ДНК

Основные направления исследований

  • Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными.
  • Термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот, формируемых с участием: тандемов олигонуклеотидов; олигонуклеотидов, несущих остатки органических лигандов (интеркаляторов, лигандов малой бороздки, флуорофоров, ненуклеотидные вставки).
  • Разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов (ДНК-лигаза, ДНК-полимераза).
  • Разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот.

Проекты и гранты
грант РФФИ (06-04-49263-а ) "«“Мостиковые” олигонуклеотиды – новые зонды с уникальными гибридизационными и ДНК-субстратными свойствами» "

грант Программы Президиума РАН (10.6 ) "«Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными». "

Грант для молодых ученых Министерства образования и науки РФ (ЗН-454-04) "«Одноцепочечный разрыв в ДНК: взаимосвязь термодинамических характеристик коаксиального стэкинга пар оснований в ДНК и эффективности ферментативого лигирования». "

Наиболее значимые публикации
Abramova, T.V., Kassakin, M.F., Lomzov, A.A., Pyshnyi, D.V., Silnikov, V.N. , "New oligonucleotide analogues based on morpholine subunits joined by oxalyl diamide tether " // Bioorganic Chemistry , 2007, 35 (3), 258 - 275

Mironova, N.L., Pyshnyi, D.V., Shtadler, D.V., Fedorova, A.A., Vlassov, V.V., Zenkova, M.A. , "RNase T1 mimicking artificial ribonuclease " // Nucleic Acids Research, 2007, 35 (7), 2356 - 2367

Виноградова О.А., Пышная И.А., Зарытова В.Ф., Иванова Е.М., Пышный Д.В. , "Повышение эффективности гибридизационного анализа путем ограниченной фрагментации ДНК-пробы. " // Молекуляр. биология, 2007, 41 (1), 163 - 172

Cherepanova, A., Tamkovich, S., Pyshnyi, D., Kharkova, M., Vlassov, V., Laktionov, P. , "Immunochemical assay for deoxyribonuclease activity in body fluids " // Journal of Immunological Methods , 2007, 325 (1-2), 96 - 103

Mal'shakova, V.S., Laktionov, P.P., Pyshnyi, D.V., Vlasov, V.V. , "Intracellular localization of natural and modified oligonucleotides in primary human endothelial cells " // Bulletin of Experimental Biology and Medicine , 2007, 143 (2), 204 - 206

Vinogradova, O.A., Pyshnaya, I.A., Zarytova, V.F., Ivanova, E.M., Pyshnyi, D.V. , "Enhancement of a hybridization analysis efficiency by the controlled DNA fragmentation " // Molecular Biology , 2007, 41 (1), 148 - 156

Lomzov A.A., Pyshnaya I.A., Ivanova E.M.. , "Hybridization of the bridged oligonucleotides with DNA: thermodynamic and kinetic studies. " // J. Biomol. Struct. Dyn, 2006 (23), 567 - 580

Mironova N.L., Pyshnyi D.V., Ivanova E.M., Zenkova M.A., Gross H.J., Vlassov V.V. , "Covalently attached oligodeoxyribonucleotides induce RNase activity of a short peptide and modulate its base specificity" // Nucleic Acids Res., 2004, 32 (6), 1928 - 1936

Pyshnyi D.V., Goldberg E.L., Ivanova E.M. , "Efficiency of coaxial stacking depends on the DNA duplex structure" // J. Biomol. Struct. Dyn., 2003, 21 (3), 459 - 468

Пышный Д.В., Кривенко А.А., Лохов С.Г., Иванова Е.М., Дымшиц Г.М., Зарытова В.Ф. , "Взаимодействие производных коротких олигонуклеотидов с нуклеиновыми кислотами VI. Дискриминация комплексов с мисматчем при лигировании тандема коротких олигонуклеотидов" // Биоорган. химия, 1998, 24 (1), 32 - 37

Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Зарытова В.Ф. , "Способ выявления анализируемой последовательности ДНК" // Патент № 2259402 от 18.08.2005

Танцующая магнитная жидкость (полная версия)
Танцующая магнитная жидкость (полная версия)

На XXI Менделеевском съезде награждены выдающиеся ученые-химики
11 сентября 2019 года в Санкт-Петербурге на XXI Менделеевском съезде по общей и прикладной химии объявлены победители премии выдающимся российским ученым в области химии. Премия учреждена Российским химическим обществом им. Д.И.Менделеева совместно с компанией Elsevier с целью продвижения и популяризации науки, поощрения выдающихся ученых в области химии и наук о материалах.

Россия подала в ЮНЕСКО заявку на учреждение премии имени Менделеева для молодых ученых
Россия подала в ЮНЕСКО заявку на учреждение премии имени Менделеева для молодых ученых. Об этом премьер-министр РФ Дмитрий Медведев сообщил, открывая встречу с нобелевскими лауреатами, руководителями химических обществ, представителями международных и российских научных организаций.

Перст-дайджест
В новом выпуске бюллетеня «ПерсТ»: Синтез “перламутровых” нанокомпозитов с помощью бактерий. Оптомагнитный нейрон.Устойчивость азотных нанотрубок. Электронные характеристики допированных фуллереновых димеров.

Люди, создающие новые материалы: от поколения X до поколения Z
Е.В.Сидорова
Самые диковинные экспонаты научной выставки, организованной в Москве в честь Международного года Периодической таблицы химических элементов в феврале 2019 г., можно было рассмотреть только "вооруженным глазом»: Таблица Д.И.Менделеева размером 5.0 × 8.7 мкм и нанопортрет первооткрывателя периодического закона великолепно демонстрировали возможности динамической АСМ-литографии на сканирующем зондовом микроскопе. Миниатюрные произведения представили юные участники творческих конкурсов XII Всероссийкой олимпиады по нанотехнологиям, когда-то задуманной академиком Ю.Д.Третьяковым — основателем факультета наук о материалах (ФНМ) Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова. О том, как подобное взаимодействие со школьниками и студентами помогает сохранить своеобразие факультета и почему невозможно воплощать идею междисциплинарного естественнонаучного образования, относясь к обучению как к конвейеру, редактору журнала «Природа» рассказал заместитель декана ФНМ член-корреспондент РАН Е.А.Гудилин.

Как наночастицы применяются в медицине?
А. Звягин
В чем преимущества наночастиц? Как они помогают ученым в борьбе с раком? Биоинженер Андрей Звягин о наночастицах в химиотерапии, имиджинговых системах и борьбе с раком кожи.

Медицинская керамика: какими будут имплантаты будущего?
В.С. Комлев, Д. Распутина
Почему керамические изделия применяются в хирургии? Какие технологии используются для создания имплантатов? Материаловед Владимир Комлев о том, почему керамика используется в медицине, как на ее основе создаются имплантаты и какие перспективы у биоинженерии

Технопредпринимательство на марше

Мы традиционно просим вас высказать свои краткие суждения по вопросу технопредпринимательства и проектной деятельности школьников. Для нас очевидно, что под технопредпринимательством и под проектной деятельностью школьников каждый понимает свое, но нам интересно ваше мнение, заодно вы сможете увидеть по мере прохождения опроса, насколько оно совпадает или отличается от мнения остальных. Ждем ваших ответов!

О наноолимпиаде замолвите слово...

Прошла XII Всероссийская олимпиада "Нанотехнологии - прорыв в Будущее!" Мы надеемся, что нам для улучшения организации последующих наноолимпиад поможет электронное анкетирование. Мы ждем Ваших замечаний, пожеланий, предложений. Спасибо заранее!

Опыт обучения в области нанотехнологического технопредпринимательства

В этом опросе мы просим поделиться опытом и Вашим отношением к нанотехнологическому технопредпринимательству и смежным областям. Заранее спасибо за Ваше неравнодушие!



 
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.