Нанотехнологическое сообщество Нанометр, все о нанотехнологиях
на первую страницу Новости Публикации Библиотека Галерея Сообщество Объявления Олимпиада ABC О проекте
 
  регистрация
помощь
 

Научные группы: Лаборатория бионанотехнологии

Пышный Дмитрий Владимирович
Организация
Ключевые слова
Область деятельности
  • Медицина
  • Нанотехнологии
  • Химическая биология
Научные интересы
  • Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными
  • разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов
  • разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот
  • термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот
Контактная информация
Телефон +7 383 335-62-28
Факс +7 383 333-36-77
Электронная почта niboch@niboch.nsc.ru
Индекс 630090
Адрес Новосибирск,пр. ак. Лаврентьева, 8
Страница научной группы в интернете
Научный коллектив
    Пышный Дмитрий Владимирович, заведующий лабораторией, кандидат наук
Описание

Зав. лабораторией Пышный Дмитрий Владимирович, кандидат химических наук, доцент, зам. директора по научной работе Новосибирскиого института биоорганической химии СО РАН. Лауреат VII конкурса молодых ученых Европейской Академии наук (1999 г), лауреат премий журнала «Биоорганическая химия» (1997 и 1998 гг), лауреат премии издательства МАИК «Наука» (1998 г)


Основные научные результаты

  • Систематически изучены физико-химические особенности образования тандемных олигонуклеотидных комплексов с ДНК.
  • исследованы особенности ферментативного лигирования олигонуклеотидов на ДНК матрице в зависимости от нуклеотидной композиции в точке одноцепочечного разрыва ДНК
  • на основе метода лигирования коротких олигонуклеотидов (трехкомпонентных тандемов) разработан ряд тест-систем для диагностики известных полиморфных сайтов в анализируемой ДНК (Y-хромосома человека, фенилкетонурия (R408W), ген Pol ВИЧ-1, генотипирование ВГС)
  • систематически изучены физико-химические особенности образования ДНК-ДНК комплексов олигонуклеотидов, несущих ненуклеотидные вставки на основе олигометилендиолов и олигоэтиленгликолей (мостиковых олигонуклеотидов)
  • с использованием олигонуклеотидов зондов, несущих ненуклеотидные вставки, разработан высокоселективный подход к анализу точечных мутаций в ДНК

Основные направления исследований

  • Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными.
  • Термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот, формируемых с участием: тандемов олигонуклеотидов; олигонуклеотидов, несущих остатки органических лигандов (интеркаляторов, лигандов малой бороздки, флуорофоров, ненуклеотидные вставки).
  • Разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов (ДНК-лигаза, ДНК-полимераза).
  • Разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот.

Проекты и гранты
грант РФФИ (06-04-49263-а ) "«“Мостиковые” олигонуклеотиды – новые зонды с уникальными гибридизационными и ДНК-субстратными свойствами» "

грант Программы Президиума РАН (10.6 ) "«Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными». "

Грант для молодых ученых Министерства образования и науки РФ (ЗН-454-04) "«Одноцепочечный разрыв в ДНК: взаимосвязь термодинамических характеристик коаксиального стэкинга пар оснований в ДНК и эффективности ферментативого лигирования». "

Наиболее значимые публикации
Abramova, T.V., Kassakin, M.F., Lomzov, A.A., Pyshnyi, D.V., Silnikov, V.N. , "New oligonucleotide analogues based on morpholine subunits joined by oxalyl diamide tether " // Bioorganic Chemistry , 2007, 35 (3), 258 - 275

Mironova, N.L., Pyshnyi, D.V., Shtadler, D.V., Fedorova, A.A., Vlassov, V.V., Zenkova, M.A. , "RNase T1 mimicking artificial ribonuclease " // Nucleic Acids Research, 2007, 35 (7), 2356 - 2367

Виноградова О.А., Пышная И.А., Зарытова В.Ф., Иванова Е.М., Пышный Д.В. , "Повышение эффективности гибридизационного анализа путем ограниченной фрагментации ДНК-пробы. " // Молекуляр. биология, 2007, 41 (1), 163 - 172

Cherepanova, A., Tamkovich, S., Pyshnyi, D., Kharkova, M., Vlassov, V., Laktionov, P. , "Immunochemical assay for deoxyribonuclease activity in body fluids " // Journal of Immunological Methods , 2007, 325 (1-2), 96 - 103

Mal'shakova, V.S., Laktionov, P.P., Pyshnyi, D.V., Vlasov, V.V. , "Intracellular localization of natural and modified oligonucleotides in primary human endothelial cells " // Bulletin of Experimental Biology and Medicine , 2007, 143 (2), 204 - 206

Vinogradova, O.A., Pyshnaya, I.A., Zarytova, V.F., Ivanova, E.M., Pyshnyi, D.V. , "Enhancement of a hybridization analysis efficiency by the controlled DNA fragmentation " // Molecular Biology , 2007, 41 (1), 148 - 156

Lomzov A.A., Pyshnaya I.A., Ivanova E.M.. , "Hybridization of the bridged oligonucleotides with DNA: thermodynamic and kinetic studies. " // J. Biomol. Struct. Dyn, 2006 (23), 567 - 580

Mironova N.L., Pyshnyi D.V., Ivanova E.M., Zenkova M.A., Gross H.J., Vlassov V.V. , "Covalently attached oligodeoxyribonucleotides induce RNase activity of a short peptide and modulate its base specificity" // Nucleic Acids Res., 2004, 32 (6), 1928 - 1936

Pyshnyi D.V., Goldberg E.L., Ivanova E.M. , "Efficiency of coaxial stacking depends on the DNA duplex structure" // J. Biomol. Struct. Dyn., 2003, 21 (3), 459 - 468

Пышный Д.В., Кривенко А.А., Лохов С.Г., Иванова Е.М., Дымшиц Г.М., Зарытова В.Ф. , "Взаимодействие производных коротких олигонуклеотидов с нуклеиновыми кислотами VI. Дискриминация комплексов с мисматчем при лигировании тандема коротких олигонуклеотидов" // Биоорган. химия, 1998, 24 (1), 32 - 37

Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Зарытова В.Ф. , "Способ выявления анализируемой последовательности ДНК" // Патент № 2259402 от 18.08.2005

Диоксид земляники
Диоксид земляники

Перст-дайджест
В новом выпуске бюллетеня «ПерсТ»: Наногибриды сражаются с опасными бактериями в клетках человека. Активный гидродинамический плащ-невидимка. Кобальтсодержащие фуллереновые комплексы для водородных накопителей.

Взгляд в Наномир! В контакте!
Как увидеть атомы, молекулы и вирусы?
Как детально рассмотреть объекты живой природы масштаба НАНО?
Принцип действия и из чего состоит атомно силовой микроскоп.
Обо всем об это расскажет профессор МГУ имени М.В.Ломоносова, руководитель компании Центр перспективных технологий, автор более 200 работ по зондовой микроскопии – Яминский Игорь Владимирович.

Перст-дайджест
В новом выпуске бюллетеня «ПерсТ»: Новые 3D пористые наноуглеродные материалы из панцирей морских крабов. Клапан без клапана: как идёт воздух в лёгких у птиц. Углеродные фуллертрубки: от полупроводников до металлов. Механическое напряжение и
поверхностное натяжение скирмионов.

Материалы к защитам выпускных квалификационных работ бакалавров ФНМ МГУ 2021
Коллектив авторов
Защиты выпускных квалификационных работ (квалификация – бакалавр материаловедения) по направлению 04.03.02 - «химия, физика и механика материалов» на Факультете наук о материалах МГУ имени М.В.Ломоносова состоятся 8, 9, 10 и 11 июня 2021 г. Начало защит в 11.00. Защиты пройдут с использованием дистанционных образовательных технологий.

Академик Е.Н. Каблов: «Для освоения космоса нужны новые материалы»
Янина Хужина
В этом году весь мир отмечает 60-летие первого полета человека в космос. Успех миссии Юрия Гагарина стал возможен благодаря слаженной работе многих людей: физиков, математиков, конструкторов, инженеров-проектировщиков и, конечно, материаловедов. «Научная Россия» обсудила с академиком РАН Евгением Кабловым основные вехи в развитии космического и авиационного материаловедения.

Материалы к защитам магистерских квалификационных работ на ФНМ МГУ в 2021 году
коллектив авторов
25 - 28 мая пройдут защиты магистерских диссертаций выпускниками Факультета наук о материалах МГУ имени М.В.Ломоносова.

Технопредпринимательство в эпоху COVID-19

Небольшой опрос о том, как изменились подходы современного предпринимательства в контексте новых и возникающих форм ведения бизнеса, онлайн образования, дистанционных форм взаимодействия и коворкинга в эпоху пандемии COVID - 19.

Технонано

Технопредпринимательство - идея, которая принесет свои плоды при бережном культивировании и взращивании. И наша наноолимпиада, и Наноград от Школьной Лиги РОСНАНО, и проект Стемфорд, и другие замечательные инициативы - важные шаги на пути реализации этой и других идей, связанных с развитием новых высоких технологий в нашей стране и привлечением молодых талантов в эту вполне стратегическую область. Ниже приведен небольшой опрос, который позволит и нам, и вам понять, а что все же значит этот модный термин, и какова его суть.

Технопредпринимательство на марше

Мы традиционно просим вас высказать свои краткие суждения по вопросу технопредпринимательства и проектной деятельности школьников. Для нас очевидно, что под технопредпринимательством и под проектной деятельностью школьников каждый понимает свое, но нам интересно ваше мнение, заодно вы сможете увидеть по мере прохождения опроса, насколько оно совпадает или отличается от мнения остальных. Ждем ваших ответов!



 
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.